Mặc dù y học ngày càng tiến bộ, lạc nội mạc tử cung vẫn là bệnh mạn tính, không thể điều trị dứt điểm hoàn toàn, kể cả khi đã phẫu thuật. Vì vậy, hướng điều trị hiện nay tập trung vào kiểm soát triệu chứng lâu dài, giảm tái phát và bảo vệ chất lượng sống.