Ban Quản lý Di sản thế giới Vịnh Hạ Long - Yên Tử có chức năng tham mưu tỉnh Quảng Ninh thực hiện công tác quản lý, bảo vệ, bảo tồn, nghiên cứu khoa học, tu bổ, tôn tạo, phục hồi và phát huy, khai thác các giá trị về cảnh quan tự nhiên, văn hóa, lịch sử, địa chất địa mạo, đa dạng sinh học.