Theo báo cáo kiểm toán việc quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công năm 2023 tại Bộ Y tế, Kiểm toán Nhà nước chỉ ra công tác quản lý, điều hành thu, chi ngân sách còn nhiều hạn chế, bất cập trong lập, thẩm định, phê duyệt chủ trương đầu tư, dự án đầu tư phát triển tại Bộ Y tế.